Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCM3P25205 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCM3P25205 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCM3P25205 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCM3P25205 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCM3P25205 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCM3P25205 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCM3P25205 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MCM3P25205 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MCM3P25205 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms