Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LMNB1P20700 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms