Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XBP1P17861 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XBP1P17861 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XBP1P17861 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms