Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI3P10071 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI3P10071 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI3P10071 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI3P10071 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI3P10071 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI3P10071 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI3P10071 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI3P10071 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GLI3P10071 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GLI3P10071 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GLI3P10071 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI3P10071 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI3P10071 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GLI3P10071 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms