Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA2O43364 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms