Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRPO00591 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRPO00591 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GABRPO00591 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms