Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms