Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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