Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms