Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms