Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMG5Q9UPR3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms