Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms