Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNA3Q9UI47 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms