Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 SPATA6-203ENST00000371847 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LAMTOR3Q9UHA4 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms