Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
THUMPD1Q9NXG2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
THUMPD1Q9NXG2 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms