Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN4Q9NQP4 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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