Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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FANCFQ9NPI8 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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FANCFQ9NPI8 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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