Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AC021087.3-201ENST00000565521 2881 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SLC24A3Q9HC58 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms