Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM31Q9BZY9 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms