Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf16Q9BUW7 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf16Q9BUW7 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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