Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KC1Q96S38 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms