Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCNAQ96QF7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.1 ms