Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COG3Q96JB2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms