Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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