Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC174Q6PII3 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms