Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAPRIN2Q6IMN6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAPRIN2Q6IMN6 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms