Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TMEM225Q6GV28 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms