Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRMS1LQ5PSV4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms