Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms