Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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