Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms