Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms