Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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SP6Q3SY56 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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SP6Q3SY56 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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SP6Q3SY56 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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SP6Q3SY56 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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