Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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KRTAP20-1Q3LI63 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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KRTAP20-1Q3LI63 CXCL13-201ENST00000286758 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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KRTAP20-1Q3LI63 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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KRTAP20-1Q3LI63 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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KRTAP20-1Q3LI63 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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KRTAP20-1Q3LI63 ST5-258ENST00000534278 1352 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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KRTAP20-1Q3LI63 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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KRTAP20-1Q3LI63 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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KRTAP20-1Q3LI63 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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