Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDRF1Q3B7T1 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms