Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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