Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IMPG1Q17R60 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms