Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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