Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDKN3Q16667 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms