Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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