Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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CDSNQ15517 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CDSNQ15517 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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