Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TLR1Q15399 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms