Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GAPVD1Q14C86 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
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