Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SHPRHQ149N8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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