Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMC1AQ14683 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMC1AQ14683 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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