Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC3Q14574 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms