Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APOFQ13790 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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APOFQ13790 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
APOFQ13790 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
APOFQ13790 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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