Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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TOP3AQ13472 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TOP3AQ13472 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TOP3AQ13472 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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