Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms