Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 GSTA2-201ENST00000493422 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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MKRN4PQ13434 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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MKRN4PQ13434 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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MKRN4PQ13434 HOPX-209ENST00000508121 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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MKRN4PQ13434 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MKRN4PQ13434 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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MKRN4PQ13434 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LINC00852-201ENST00000475197 1328 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MKRN4PQ13434 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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